دکتر مجازی - زهره محمدی

گیرنده‌های شبه تول: سنسورهای تشخیص عفونت

انواع فراوانی از میکروب‌ها از جمله ویروس‌ها، باکتری‌ها، قارچ‌ها و تک یاخته‌ها آماده حمله به بدن انسان و استفاده از محیط سرشار از مواد غذایی هستند که فراهم می‌کند. خوشبختانه پاسخ ایمنی به عنوان یک سیستم دفاعی عمل و با…

تکنیک FISH

تکنیک‌هایی که پیش‌تر به آن‌ها پرداختیم، وابسته به هیبریداسیون مولکول‌های DNA و یا RNA خالص‌شده‌ای هستند که در ژل آگارز قرار دارند. در تکینک FISH (Fluorescent in situ hybridization)، مولکول‌های پروب مستقیما با مولکول‌های DNA و RNA داخل سلولی هیبرید…

تکنیک DNA microarray

DNA microarry‌ ها، تکنیک‌هایی بر پایه هیبریداسیون هستند، اما در مقیاسی مینیاتوری اجرا می‌شوند. در نتیجه این کار می‌توان به طور همزمان میلیون‌ها مولکول هدف را آنالیز نمود. تکنولوژی‌های هیبریداسیون microarray در اوایل دهه ۱۹۹۰ توسعه یافتند و امکان انجام…

تکنیک Northern Blotting

تکنیک‌های Northern blotting نیز مانند Southern blotting بر پایه هیبریداسیون اسیدهای نوکلئیک هستند و تفاوت‌شان در آن است که مولکول‌های هدف، RNA های هضم‌نشده (معمولا mRNAها) می‌باشند. این تکنیک‌ها به منظور سنجش اندازه رونوشت‌ها و نیز دستیابی به الگوی بیان…

تکنیک Southern blotting

این تکنیک ژنتیک مولکولی، برای نخستین بار در سال ۱۹۷۵ و توسط Edwin Southern معرفی شد و هدف از انجام آن، تشخیص واریانت‌های ژنتیکی بود. کاربرد مهم هیبریداسیون Southern blotting در تعیین توالی‌های هدفی است که مشابه ژن مورد استفاده…

پروب های نوکلئیک اسیدی

با افزایش روزافزون توالی‌های نوکلئیک‌اسید شناخته شده و نیز وجود روش‌هایی برای سنتز الیگونوکلئوتیدهای دلخواه، امروزه می‌توان قطعات DNA تک‌رشته‌ای کوتاهی را برای انجام هیبریداسیون DNA طراحی کرد. این قطعات پروب ‌DNA نامیده‌ می‌شوند. پروب‌ها، مولکول‌های DNA ای هستند که…

الکتروفورز DNA

تکنیک الکتروفورز در ژل به منظور جداسازی قطعات DNA بر اساس اندازه به کار می‌رود و به این منظور از تفاوت‌های بار الکتریکی مولکول‌های موجود در مخلوط استفاده می‌نماید. مولکول‌های DNA دارای بار منفی هستند؛ در نتیجه با قرار گرفتن…

تکنیک توالی یابی Illumina

اساس تکنیک توالی یابی Illumina  تکنیک دی دئوکسی است، اما از نوآوری‌های فراوان دیگری نیز بهره برده است. در این تکنیک علی‌رغم پایین بودن تعداد توالی‌های خوانده شده، محصولات بیشتری نسبت به تکنیک توالی یابی ۴۵۴ تولید می‌شود. طی این…

تکنیک توالی یابی ۴۵۴

Massively parallel pyrosequencing در سال ۲۰۰۵ توسط شرکت ۴۵۴ Life Sciences توسعه یافت و توسط Roche تجاری‌سازی شد. این تکنیک، توالی یابی ۴۵۴ نام دارد و نخستین تکنیک از توالی یابی‌های نسل جدید است. توالی یابی ۴۵۴ می‌تواند بیش از…

توالی یابی نسل جدید (NGS)

معرفی توالی یابی نسل جدید (Next Generation Sequencing= NGS) در سال ۲۰۰۷ تحولی در دنیای ژنومیکس پدید آورد، روشی کاملا جدید برای تعیین توالی DNA معرفی نمود و هزینه و زمان موردنیاز برای توالی یابی ژنوم را به شدت کاهش داد.…